Original Posted By Mitochi►DNA itu adalah phosphate + deoxyribose + nucleoside yg disusun2 kaya tangga. Tau kan bentuknya double helix? Beginian bukannya ada ya di wikipedia


Basepairing:


Single stranded DNA bisa basepairing (connect pake hydrogen bond, dikarenakan hydrophobic effect) dengan single stranded DNA yg lain dan basepair yg paling pas itu mostly selalu antara Adenine + Thymine/Uridine atau Guanine + Cytosine. Kaya main puzzle aja kalo ga pas kan ga bisa masuk tuh. Jadi kalo kaya Adenine + Cytosine itu ngga pas jadinya ga bisa basepair.
*Generally Thymine itu ada di DNA, sedangkan Uridine sebagai pengganti Thymine di RNA.

Gimana cara baca nya?
Transcription: Ada protein namanya RNA Polymerase yg bisa "ngebaca" (Transcribe) DNA dengan cara synthesize RNA matching dengan setiap nucleotide di DNA. Gimana tau bisa matching? Ya liat pas apa ngga basepairingnya. Kalo ga pas ya cari nucleotide yg pas. Di dareah situ banyak single nucleotide btw.



Jadi intinya si RNA polymerase bakalan bikin RNA yg diproses lagi jadi messenger RNA
Sequencenya mRNA adalah komplementnya DNA dari mana dia di baca.

Translation: Messenger RNA ini bakalan dibaca lagi sequencenya sama protein/RNA complex namanya ribosome dan ribosome bakalan ngambil amino acid yg digantung sama tRNA yg juga punya sequence sendiri (codon). Gimana bisa tau ngambil amino acid yg bener apa ngga? Ya liat lagi basepairingnya pas ga. Bener2 persis kaya org bikin jigzaw puzzle.


Itu yg biru tua tRNA, yg gede bgt (ijo muda + krem) itu ribosome, yg item2 kecil di antaa ijo muda/krem itu mRNA, yg hitam2 di atas biru tua yg di dlm ribosome itu kumpulan amino acid yg lagi dibikin jadi protein.
Itu proteinnya lagi dibawa ke ER untuk diproses lebih lanjut.

Contoh
DNA sequence TACATGCGTACG
ditranscribe oleh RNA Polymerase jadi AUGUACGCAUGC
ditranslate oleh ribosome jadi Met-Tyr-Ala-Cys
Met-Tyr-Ala-Cys itulah proteinnya.

Original Posted By Mitochi►Protein itu disusun oleh amino acid. Amino acid tersusun oleh chemical element. Chemical element yg paling bnyk adalah chemical2 organik yaitu Carbon, Nitrogen, Hydrogen, Sulphur.

Amino acid yg sendirian: NH2-C(R)-COOH
Kalo rame: NH2-C(R)-C(O)-NH-C(R)-C(O)-NH-C(R)-C(O)- etc. Keliatan kan patternnya? (N-C(R)-C)n

(R) itu maksudnya side chain, ada 21 jenis side chain amino acid, makanya ada 21 jenis amino acid.
Jenis2nya bisa liat di copasan wiki (susah gambar di sini)


Jadi pattern 1 amino acid selalu N-C-C, yg bedain itu adalah side chain (R) nya.
Amino acid ini bisa ditempel2 dengan amino acid laen dengan covalent bond (peptide bond) buat bikin protein (2+ amino acid itu biasa uda disebut protein) dengan struktur yg beda2, uda persis kaya lego brick aja (lego yg paling kecil benjolannya cuma 1)


Beda nya kalo lego brick kecil kan cuma bisa nempel 1 arah, kalo amino acid di protein selain nempel pake covalent bond dia juga bisa nempel dengan chemical bond laen yg tidak sekuat covalent bond, yaitu contohnya hydrophobic effect (karena protein biasanya di air), hydrogen bond, ionic bond, disulfide bond.

Jadi selain struktur NCC-NCC-NCC-NCC-NCC-NCC yg 1 dimensi, dia bisa bikin secondary structure yg 2 dimensi, antara protein yg jaraknya deket2. Contohnya alpha helix. Alpha helix ini mirip tapi tidak sama dengan double helix DNA


Atau beta sheet


Lalu ada lagi tertiary structure, kasarnya itu struktur komplitnya protein, jadi gimana arah foldingnya, letak atom satu dengan yg laen.

Contohnya di bawah ini ditempel pake disulfide bond


Jadi kalo analogi lego, brick2nya sekarang ditambahin lobang ditengah2nya jadi kaya lego technic.


Quaternary structure, itu protein tertiary yg gabung2 dengan protein sejenis buat bikin fungsi ganda. Gabungan ini biasa distabilisasi sama metal ion (Zinc, Magnesium). Kaya di Power Rangers robot2 kecilnya bisa gabung jadi robot gede.

Ada lagi complex, itu artinya protein yg ga sejenis gabung2 mirip kaya quaternary structure.

=========================================

Bener, cahaya matahari itu kalo di DNA bikin yg namanya Thymine-Thymine dimer atau Thymine-Cytosine dimer.

Radiasi cahaya matahari itu constantly bikin Thymine di DNA kulit elu yg sebelahan sama Thymine atau Cytosine lain dimerize kaya di gambar. Efek dimer ini adalah RNA polymerase yg transcribe DNA jadi ngadat karena ga bisa baca.
Untungnya Thymine dimer ini "dibetulin" sama bbrp DNA repair protein yg namanya Xerodema Pigmentosum A, B, C, etc sampe G.

Tapi jumlah protein ini tentu ada batasnya jadi kalo kebanyakan Thymine dimer ga semua bisa direpair. Kalo ini terjadi bisa kacau, bisa2 protein yg harusnya dibikin jadi ga ada gara2 DNAnya ga bisa di transcribe, apalagi kalo yg kena adalah protein2 penting yg tugasnya menjaga kestabilan DNA. Anggap aja XP ini adalah pemadam kebakaran, kalo kebakaran cuma di 1 daerah kan bisa ditangani cepat tapi kalo kebakaran di mana2 ya kelabakan juga. Kalo kebanyakan unrepaired pyrimidine dimer at one time bisa kacau, efek tidak langsung terjadi mutasi -> kanker kulit, karena balance cellnya secara tidak langsung jadi ngawur.
Pigment yg di kulit lu (melanin) itu gunanya kaya payungnya DNA. Makanya org yg kulitnya hitam kaya Indonesia jarang kena kanker kulit meskipun sering mandi sinar matahari.