Berdasarkan pengertiannya, keanekaragaman hayati dapat dibedakan menjadi tiga macam, yaitu keanekaragaman gen (genetik), keanekaragaman spesies (jenis), dan keanekaragaman ekosistem.

Keanekaragaman gen (genetik) merupakan biodiversitas yang merujuk pada jumlah total variasi genetik dalam keseluruhan spesies yang mendiami sebagian atau seluruh permukaan bumi yang dapat didiami (wikipedia). Contohnya buah mangga yang kita kenal ada mangga gadung, mangga arumanis, mangga manalagi, mangga golek, dan lain-lain. Keanekaragaman mangga tersebut baik dari bentuk, aroma, maupun rasanya menyebabkan mangga memiliki bermacam-macam jenis seperti yang sudah ane sebutin tadi. Keanekaragaman dalam satu spesies inilah yang kita sebut sebagai keanekaragaman tingkat gen.

Keanekaragaman jenis (spesies) adalah perbedaan yang dapat ditemukan pada komunitas atau kelompok berbagai spesies yang hidup di suatu tempat. Contohnya di suatu halaman terdapat pohon mangga, kelapa, jeruk, rambutan, bunga mawar, melati, cempaka, jahe, kunyit, burung, kumbang, lebah, semut, kupu-kupu, dan cacing. Keanekaragaman jenis yang lebih tinggi umumnya ditemukan tempat yang jauh dari kehidupan manusia, misalnya di hutan. Di hutan terdapat jenis hewan dan tumbuhan yang lebih banyak dibanding dengan di sawah atau di kebun.

Keanekaragaman ekosistem dapat terjadi karena perbedaan letak geografis. Perbedaan letak geografis antara lain merupakan faktor yang menimbulkan berbagai bentuk ekosistem. Perbedaan letak geografis menyebabkan perbedaan iklim. Perbedaan iklim menyebabkan terjadinya perbedaan temperatur, curah hujan, intensitas cahaya matahari, dan lamanya penyinaran. Keadaan ini akan berpengaruh terhadap jenis-jenis flora (tumbuhan) dan fauna (hewan) yang menempati suatu daerah. Keanekaragaman jenis-jenis flora dan fauna yang menempati suatu daerah akan membentuk ekosistem yang berbeda maka terbentuklah keanekaragaman tingkat ekosistem.

Cacing spesies endogenik merupakan binatang tanah yang hidup dan makan di dalam  tanah,  makanannya  yaitu bahan organik termasuk akar-akar yang telah mati didalam tanah, dan sering pula mencernakan   sejumlah   besar   mineral   tanah.   Kelompok   cacing   ini   berperan penting  dalam  mencampur  serasah  yang  ada  di  atas  tanah  dengan  tanah  lapisan bawah  dan  meninggalkan  liang  dalam  tanah.  Kelompok  cacing  ini membuang kotorannya  didalam  tanah.  Kotoran  cacing  ini  lebih  kaya  akan  karbon  dan  hara lainnya dari pada tanah disekitarnya. Adapun faktor-faktor lingkungan yang mempengaruhi kehidupan cacing tanah, antara lain kelembaban tanah, suhu tanah, pH tanah, kandungan dan distribusi material organik, vegetasi, dan musim.

Keberadaan cacing  tanah (Lumbricina)  dalam  suatu  ekosistem  sangat  penting  untuk  diketahui. Cacing  tanah telah  terbukti  baik sebagai bioamelioran (jasad   hayati   penyubur   dan   penyehat)   tanah   terutama   melalui kemampuannya  dalam  memperbaiki  sifat-sifat  tanah  seperti  ketersediaan hara, dekomposisi  bahan  organik,  pelapukan  mineral  sehingga  mampu meningkatkan produktivitas   tanah, sehingga   keberadaanya   perlu   untuk   diketahui   untuk mengetahui kondisi suatu tanah.

Cacing  tanah  dan  binatang  tanah  sangat  berperan  dalam  penghancuran bahan  organik  secara  fisik,  dari  ukuran  besar  menjadi  menjadi  ukuran  ukuran yang   lebih   kecil,   sehingga   lebih   mudah   dilapuk   lebih  lanjut   oleh   jasad mikro. Bahan  organik  mudah  lapuk  berfungsi  sebagai  sumber  hara  bagi  tanaman. Bahan  organik  kaya  N,  miskin  C  akan  cepat  dimineralisasi dan menghasilkan  ion-ion   dari   berbagai   unsur   hara   esensial.

yang ijo-ijo emang selalu seger gan

Dewasa ini, lahan atau kebun sayuran utamanya memiliki sistem pengelolaan yang dikelola secara intensif oleh manusia yang masih menggunakan pupuk kimia/pestisida. Pestisida  dapat  mempunyai efek  langsung pada  cacing  tanah  dan  menghasilkan efek  laten terhadap  pertumbuhan  dan reproduksinya. Cacing    tanah    yang    telah    terkontaminasi    pestisida    dapat menunjukkan suatu sumber kontaminasi anggota rantai makanan yang lebih besar. Pestisida    biasanya    masuk ke    tanah    sebagai    residu    penyemprotan    yang diaplikasikan  ke  tanaman  dari  atas  tanah.  Insektisida  juga  sangat  merusak  cacing tanah ketika diaplikasikan ke tanah. Di sisi lain, Pemakaian pupuk kimia tanpa adanya tambahan pupuk organik telah menjadikan pertanian secara ekonomi  kurang menguntungkan dan yang lebih mengkhawatirkan adalah kerusakan lahan pertanian.

Suatu penelitian yang dilakukan di lahan pertanian Batu - Malang menunjukkan kepadatan cacing pada lahan alami tanpa penggunaan pupuk kimia diperoleh 15.200 individu/m3, sedangkan pada lahan dengan penggunaan pupuk kimia menunjukkan kepadatan cacing hanya 1.600 individu/m3. Hal ini menunjukkan bahwa kawasan konservasi dengan pengelolaan lahan yang dikelola secara alami memiliki kondisi yang mendukung untuk pertumbuhan cacing tanah dibandingkan dengan yang dikelola secara intensif oleh manusia. Tentu saja, lahan atau kebun dengan kepadatan cacing tertinggi berpengaruh terhadap peningkatan hasil panen. Sungguh bermanfaat .

Karena pemanfaatan cacing tanah pada lahan/kebun pertanian telah jelas dan terbukti secara ilmiah, maka dengan ini diharapkan penggunaan pestisida kedepannya dapat berkurang supaya agens hayati seperti cacing dapat tumbuh dan berkembang tidak hanya menyuburkan tanah secara alami namun juga dapat menjaga keberlangsungan suatu ekosistem.