Salah satu langkah maju dalam up-grade
Nakhoda Ragam Class, adalah pengadaan
sistem pertahanan udara VL Mica, buatan
MBDA Perancis. Dengan adanya VL Mica,
pertahanan udara kapal perang ini, mampu
menyergap sasaran sejauh 20 km dengan
ketinggian 30 ribu kaki, untuk segala jenis
ancaman udara. VL Mica memiliki hulu
ledak 12 kg dan berkemampuan fire and
forget.
VL Mica menggantikan sistem rudal anti
pertahanan udara Seawolf yang dipasang
Brunei Darussalam di NR Class pada tahun
2005-an, namun rudal ini sudah tidak
diproduksi oleh MBDA. Rudal Seawolf
digantikan dengan versi yang lebih baru
CAMM-L.
Jika dibandingkan denga sistem
pertahanan udara Korvet Sigma Class,
maka NR Class mengalami peningkatan.
KRI Diponegoro Sigma yang mulai bertugas
tahun 2007, hanya dilengkapi rudal anti-
udara Mistral TETRAL, buatan MBDA.
Pertahanan udara Mistral Tetral, hanya
bisa menetralisir ancaman udara jarak
dekat dengan jangkauan 5 kilometer dan
low altitude. Dengan jangkauan itu, Mistral
hanya bisa melumpuhkan helikopter
ataupun rudal yang datang (low altitude)
dan telah sangat dekat. Pesawat tempur
musuh dan rudal Sea Skimmers relatif
aman dari ancaman Mistral.